RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLTPP55058 493 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ERVK-25P63136 954 aa-1.68□□□□□ -2.68
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM11P17152 192 aa-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TUFMP49411 452 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-540P-201ENST00000384622 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-1.69□□□□□ -2.68
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CCL23P55773 120 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 RND3P61587 244 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 BDH1Q02338 343 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC3A1Q07837 685 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCRN3Q0VDG4 424 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC17A1Q14916 467 aa-1.69□□□□□ -2.68
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