RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 G6PC2Q9NQR9 355 aa15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 DLL4Q9NR61 685 aa15.17■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 A0A0A6YYH2 397 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 A6NJ64 397 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 H3BSH0 61 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 H2BFMP0C1H6 154 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 HTR2CP28335 458 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 MMP16P51512 607 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 MYBPHQ13203 477 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 THEM4Q5T1C6 240 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 TSSK4Q6SA08 328 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 BEST4Q8NFU0 473 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 GSX2Q9BZM3 304 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 TAS2R4Q9NYW5 299 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 H3BML4 177 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SULT1C2O00338 296 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 WNT11O96014 354 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ALDOBP05062 364 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 IL32P24001 234 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SSTR2P30874 369 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 BIDP55957 195 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PHF19Q5T6S3 580 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 MDGA2Q7Z553 956 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 UEVLDQ8IX04 471 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SPICQ8N5J4 248 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 EDAQ92838 391 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SLC25A28Q96A46 364 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 MED29Q9NX70 200 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 KIF25Q9UIL4 384 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 FLVCR2Q9UPI3 526 aa15.16■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SPEGQ15772 3267 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 TP53I11O14683 189 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SNAPC5O75971 98 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 HPXP02790 462 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ADH6P28332 368 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PRSS3P35030 304 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PLA2G7Q13093 441 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 LINC00303Q3SY05 128 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 OR2M3Q8NG83 312 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 POC1BQ8TC44 478 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 IFI44Q8TCB0 444 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 RELTQ969Z4 430 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 A0A1W2PPL8 197 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 RAD1O60671 282 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 DKK1O94907 266 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PTHLHP12272 177 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ZP3P21754 424 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 EFNB2P52799 333 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ACTBP60709 375 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ACTG1P63261 375 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 SLC25A25Q6KCM7 469 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 ELP5Q8TE02 316 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 PTX4Q96A99 478 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 RASL10BQ96S79 203 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 B3GAT1Q9P2W7 334 aa15.15■□□□□ 0.02
PRRX1-202ENST00000367760 EFNA2O43921 213 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 IGHG1P01857 330 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 AKAIN1P0CW23 69 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 GABRA1P14867 456 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 LAP3P28838 519 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 PIGKQ92643 395 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.14■□□□□ 0.01
PRRX1-202ENST00000367760 C1orf198Q9H425 327 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.9 ms