RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 HMGN4O00479 90 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO24O75426 580 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SPI1P17947 270 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZSR9 355 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 GAREM1Q9H706 876 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 R4GMQ9 66 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 IDSB3KWA1 339 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ADAM12O43184 909 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR8G1Q15617 311 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 YIPF5Q969M3 257 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MBOAT4Q96T53 435 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ATF6BQ99941 703 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PLPP1O14494 284 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CTDSP2O14595 271 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SBK2P0C263 348 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 RAB1AP62820 205 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CRMP1Q14194 572 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SYT9Q86SS6 491 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PP6455Q8WZ26 134 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SPP1P10451 314 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PDFQ9HBH1 243 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NSG2Q9Y328 171 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 LGALS8O00214 317 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MAKP20794 623 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 HTR4Q13639 388 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 COPS3Q9UNS2 423 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PRKACAP17612 351 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 COX5AP20674 150 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CD1CP29017 333 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TDHQ8IZJ6 230 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MARC2Q969Z3 335 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MED30Q96HR3 178 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TPPPO94811 219 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 IL11RAQ14626 422 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SSX2Q16385 188 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR51B6Q9H340 312 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 M0QZ24 198 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 FZD2Q14332 565 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PPP5D1E7EU14 171 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CRYAAP02489 173 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CSF3P09919 207 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 DIO1P49895 249 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 PGBD5Q8N414 524 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 NT5CQ8TCD5 201 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR5H15A6NDH6 313 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR5H14A6NHG9 310 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 OR5H1A6NKK0 313 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 CASP3P42574 277 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEB1P43366 347 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-201ENST00000356100 BAGE3Q86Y29 109 aa5.49□□□□□ -1.53
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