RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 DCTN6O00399 190 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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CLN8-201ENST00000331222 APELAP0DMC3 54 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ACKR3P25106 362 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 RAP2BP61225 183 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 KCTD11Q693B1 232 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 LCN15Q6UWW0 184 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.66□□□□□ -0.86
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CLN8-201ENST00000331222 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 VEZF1Q14119 521 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 RAB35Q15286 201 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 SMUG1Q53HV7 270 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 Q56UQ5 140 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.66□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 OR2T7P0C7T2 308 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 BMP2P12643 396 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ALOX5APP20292 161 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 H3F3AP84243 136 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 CBLL1Q75N03 491 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 DNAJB5O75953 348 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 CT45A10P0DMU9 189 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 TM4SF4P48230 202 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 KIRREL1Q96J84 757 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 MSL2Q9HCI7 577 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 TREX1Q9NSU2 369 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 A0A0B4J203 849 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ZNF724A8MTY0 619 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
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CLN8-201ENST00000331222 ISL2Q96A47 359 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 DBX1A6NMT0 343 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 FAM157AC9JC47 383 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 HAAOP46952 286 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 DLX5P56178 289 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 HTR4Q13639 388 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 EMCNQ9ULC0 261 aa9.65□□□□□ -0.86
CLN8-201ENST00000331222 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.65□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PRDX4Q13162 271 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.65□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SPINK4O60575 86 aa9.65□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 CD27P26842 260 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CSNK1G2P78368 415 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.65□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TPRP12270 2363 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LRIT2A6NDA9 550 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LY86O95711 162 aa9.64□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PPP3CBP16298 524 aa9.64□□□□□ -0.87
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