RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 PADI1Q9ULC6 663 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM221AA4D161 298 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CYR61O00622 381 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 KLF4O43474 513 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 KNG1P01042 644 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4A8P0C604 315 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GJA4P35212 333 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ACVRL1P37023 503 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RND2P52198 227 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PRDX4Q13162 271 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GUK1Q16774 197 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 STPG1Q5TH74 334 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TXNDC8Q6A555 127 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 LYG1Q8N1E2 194 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GHSRQ92847 366 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC32A1Q9H598 525 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C20orf202A1L168 122 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CDHR4A6H8M9 788 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP5D1E7EU14 171 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNAB3O43448 404 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 HPRT1P00492 218 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 DTYMKP23919 212 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NIPAL3Q6P499 406 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FCRLAQ7L513 359 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM99Q8N816 258 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SMIM19Q96E16 107 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NUDT11Q96G61 164 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SUSD3Q96L08 255 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SMIM14Q96QK8 99 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ARV1Q9H2C2 271 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A0B4J2A0 478 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 LRP3O75074 770 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 BPNT1O95861 308 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IGSF6O95976 241 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF735P0CB33 412 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CX3CR1P49238 355 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PNLIPRP1P54315 467 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35A1P78382 337 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5I1Q13606 314 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NR0B2Q15466 257 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FRG2Q64ET8 278 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 LYG2Q86SG7 212 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 D2HGDHQ8N465 521 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FRG2BQ96QU4 278 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.65□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 H0YIZ8 118 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GPANK1O95872 356 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TIMP1P01033 207 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 IFNA21P01568 189 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ELFN1P0C7U0 828 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 LIPCP11150 499 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 GLIPR1P48060 266 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC6A12P48065 614 aa6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
GTF2E1-201ENST00000283875 ARF6P62330 175 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms