RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 BAXQ07812 192 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 Q6ZSR9 355 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO17Q96EF6 278 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 FCER1GP30273 86 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SELENOPP49908 381 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GCNT2Q8N0V5 402 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MED20Q9H944 212 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PNV4 684 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 FRS3O43559 492 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 NMBP08949 121 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CT45A8P0DMV1 189 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CT45A9P0DMV2 189 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 DAP3P51398 398 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MZT1Q08AG7 82 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GPR18Q14330 331 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 CT45A2Q5DJT8 189 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 WDR73Q6P4I2 378 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PLPP6Q8IY26 295 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 OR4C16Q8NGL9 310 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ABLIM3O94929 683 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 DLK1P80370 383 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SLC43A2Q8N370 569 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GPR137CQ8N3F9 429 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MIXL1Q9H2W2 232 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 C5P01031 1676 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 B4DEV8 164 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 OR8G3PP0DMU2 310 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MLF1P58340 268 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF628Q5EBL2 1059 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LCN15Q6UWW0 184 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 SELENOIQ9C0D9 397 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 LPAR3Q9UBY5 353 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 P2RX1P51575 399 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 EGLN2Q96KS0 407 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 MAST2Q6P0Q8 1798 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRO-201ENST00000281171 XCR1P46094 333 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 VEGFBP49765 207 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SGCAQ16586 387 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 VWA1Q6PCB0 445 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SH2D5Q6ZV89 423 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 OR5L1Q8NGL2 311 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CTDSP1Q9GZU7 261 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ELOVL3Q9HB03 270 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ICAM2P13598 275 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 DIO1P49895 249 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 STUMQ69YW2 141 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CLEC1AQ8NC01 280 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 M1APQ8TC57 530 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TEX37Q96LM6 180 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 MYADMQ96S97 322 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 ABHD6Q9BV23 337 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 LHX6Q9UPM6 363 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NUP98P52948 1817 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GTQ1 180 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 SFTPCP11686 197 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CXCL3P19876 107 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TBPP20226 339 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 GABRR1P24046 479 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 HLA-DRB3P79483 266 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 WDR5BQ86VZ2 330 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 OR51F2Q8NH61 342 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 IFI44Q8TCB0 444 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 PDXPQ96GD0 296 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 MOKQ9UQ07 419 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRO-201ENST00000281171 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms