RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 CLEC14AQ86T13 490 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ST8SIA1Q92185 356 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR7D2Q96RA2 312 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 INTS14Q96SY0 518 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TEX101Q9BY14 249 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TREX1Q9NSU2 369 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.13□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TMEM202A6NGA9 273 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 A6NIN4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GABARAPH6UMI1 98 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CDK2AP1O14519 115 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 HBE1P02100 147 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ALPLP05186 524 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A6P0DMU7 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A5P0DMU8 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A7P0DMV0 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A8P0DMV1 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A9P0DMV2 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 COL19A1Q14993 1142 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CD200R1Q8TD46 325 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 UCK1Q9HA47 277 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 A8MVM7 634 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MAP2K6P52564 334 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TNK1Q13470 666 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TMEM18Q96B42 140 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 F2RL2O00254 374 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MT-ATP6P00846 226 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 FUT1P19526 365 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 IMPA1P29218 277 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GFERP55789 205 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TAS2R30P59541 319 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 AKR1C1Q04828 323 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GUK1Q16774 197 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CST9LP1Q5W188 147 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 ZNF75AQ96N20 296 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 RNF150Q9ULK6 438 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TNFSF12O43508 249 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GOSR1O95249 250 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CTSLP07711 333 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 EPXP11678 715 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PTTG1IPP53801 180 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SULF2Q8IWU5 870 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR51A7Q8NH64 312 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 DOK4Q8TEW6 326 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.12□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PPP5D1E7EU14 171 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OPN1LWP04000 364 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 FURINP09958 794 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 LIPAP38571 399 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GSK3AP49840 483 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 GZMKP49863 264 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 CLINT1Q14677 625 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 DCAF10Q5QP82 559 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.11□□□□□ -1.27
USP3-201ENST00000268049 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms