RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262805.16

PDE4C-201, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 2,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-201ENST00000262805 LMO7DNF2Z398 122 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 OR7A5Q15622 319 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.95□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 H3BUI4 141 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RLN2P04090 185 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CD37P11049 281 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 PTGS2P35354 604 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 FBXW4P57775 412 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 LYPD6Q86Y78 171 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SPERTQ8NA61 448 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ASB10Q8WXI3 467 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MVB12AQ96EY5 273 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MFFQ9GZY8 342 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 VDAC3Q9Y277 283 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 METTL12A8MUP2 240 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ZP3P21754 424 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CRABP1P29762 137 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ARSKQ6UWY0 536 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 OR1S1Q8NH92 325 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RAB33BQ9H082 229 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CENPMQ9NSP4 180 aa14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CCSO14618 274 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MPGP29372 298 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TOMM20Q15388 145 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MPPED2Q15777 294 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CD163Q86VB7 1156 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 STPG2Q8N412 459 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 FAM46BQ96A09 425 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CYYR1Q96J86 154 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 EMC6Q9BV81 110 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MED11Q9P086 117 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 PMS2P2O95744 297 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CYB5AP00167 134 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF823P16415 610 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CALCRP30988 508 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 DHRS2Q13268 280 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RNF144BQ7Z419 303 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 FOXQ1Q9C009 403 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.93□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SULT1C2O00338 296 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MELTFP08582 738 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RNF4P78317 190 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TDGQ13569 410 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 FGGYQ96C11 551 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 KCNK17Q96T54 332 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 VSIG4Q9Y279 399 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 RPA2P15927 270 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 ACHEP22303 614 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 PRKACBP22694 351 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PDE4C-201ENST00000262805 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms