RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.67□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 RASL12Q9NYN1 266 aa11.67□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 URADA6NGE7 173 aa11.67□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 XKRYO14609 159 aa11.67□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 ICOSLGO75144 302 aa11.67□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 CALCBP10092 127 aa11.67□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 C5AR1P21730 350 aa11.67□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 C17orf105B2RV13 164 aa11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 APODP05090 189 aa11.66□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 BATF2Q8N1L9 274 aa11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 SLC26A10Q8NG04 563 aa11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.66□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 SOHLH2Q9NX45 425 aa11.66□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 ZNF584Q8IVC4 421 aa11.66□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.66□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.66□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.66□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 HMSDA8MTL9 139 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 RAB3AP20336 220 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 FCARP24071 287 aa11.65□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.65□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 ZNF550Q7Z398 422 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 ABHD6Q9BV23 337 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.65□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 ZNF208O43345 1280 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 ASB5Q8WWX0 329 aa11.65□□□□□ -0.54
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SNX1-201ENST00000261889 CHRDQ9H2X0 955 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.65□□□□□ -0.54
SNX1-201ENST00000261889 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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SNX1-201ENST00000261889 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 IGSF11Q5DX21 431 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 CARD17Q5XLA6 110 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 WDR92Q96MX6 357 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 ZNF175Q9Y473 711 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 OR14I1A6ND48 311 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 FOXS1O43638 330 aa11.64□□□□□ -0.55
SNX1-201ENST00000261889 RENP00797 406 aa11.64□□□□□ -0.55
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