RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 H3BUI4 141 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 FADS1O60427 444 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 DOK2O60496 412 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 RP2O75695 350 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 AQP8O94778 261 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 ACHEP22303 614 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 C1QL3Q5VWW1 255 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 TMUB2Q71RG4 321 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 ASCL5Q7RTU5 278 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 OR8K3Q8NH51 312 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 OR52N5Q8NH56 324 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 STT3BQ8TCJ2 826 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 R4GMQ9 66 aa23.52■■□□□ 1.36
TPI1-201ENST00000229270 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 TIAF1O95411 115 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 AHSA1O95433 338 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 PRSS58Q8IYP2 241 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 PRR22Q8IZ63 422 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 GABRG1Q8N1C3 465 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ABHD6Q9BV23 337 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SLC22A13Q9Y226 551 aa23.51■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 LDLRAD4O15165 306 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SCRG1O75711 98 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 PNPP00491 289 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 RLN1P04808 185 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SPARCP09486 303 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ZNF250P15622 560 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 HTR2CP28335 458 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 PTGS2P35354 604 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 RPS27P42677 84 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 GLO1Q04760 184 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 PCK2Q16822 640 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 C1orf100Q5SVJ3 147 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ASPHD2Q6ICH7 369 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NDUFAF7Q7L592 441 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 BIVMQ86UB2 503 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 OR51S1Q8NGJ8 323 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 RDH8Q9NYR8 311 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 GPANK1O95872 356 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 RAB6AP20340 208 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SLC26A5P58743 744 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ADAM8P78325 824 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 OR52B4Q8NGK2 314 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 REG4Q9BYZ8 158 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 HHLA2Q9UM44 414 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.5■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 MPDZO75970 2070 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 LRP3O75074 770 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 CD74P04233 296 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 RPA2P15927 270 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 CTLA4P16410 223 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ZP3P21754 424 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 TMEM205Q6UW68 189 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NHLRC1Q6VVB1 395 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NKAIN3Q8N8D7 197 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 TMEM234Q8WY98 164 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SLC25A36Q96CQ1 311 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SEH1LQ96EE3 360 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SESN1Q9Y6P5 492 aa23.49■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 MFSD2BA6NFX1 497 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 KDM4BO94953 1096 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 NUDT14O95848 222 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ABCD3P28288 659 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 H2BFSP57053 126 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 GUCA2AQ02747 115 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 TMEM65Q6PI78 240 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 SLC35D2Q76EJ3 337 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 EXO5Q9H790 373 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ZNF224Q9NZL3 707 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 LRP12Q9Y561 859 aa23.48■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 CD3DP04234 171 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 ACSM4P0C7M7 580 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 MPZP25189 248 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 DCDP81605 110 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 CLVS2Q5SYC1 327 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 PHF19Q5T6S3 580 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 TMEM244Q5VVB8 128 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 OR4D10Q8NGI6 311 aa23.47■■□□□ 1.35
TPI1-201ENST00000229270 OR5M1Q8NGP8 315 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms