RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtg2A2AFK4 405 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esp18A8R0V1 91 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm14744B1AVU4 173 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TagapB2RWW0 714 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mettl11bB2RXM4 283 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hpse2B2RY83 592 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm4871D3Z0W7 314 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm43517E9PYS1 339 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10608E9PZ13 166 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6811E9Q3Y8 510 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spdye4cI6XKQ3 339 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21800J3QMJ9 180 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ntn1O09118 604 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnase2bO35292 155 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clk3O35492 638 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agr2O88312 175 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cops4O88544 406 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nudt19P11930 357 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcne1P23299 129 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 VipP32648 170 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab12P35283 243 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LtbP41155 306 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sat1P48026 171 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hnf4aP49698 474 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sult2a2P50236 285 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acod1P54987 488 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc42P60766 191 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arl1P61211 181 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnj8P97794 424 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CbfbQ08024 187 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab42Q0PD08 215 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tigd2Q0VBL1 525 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 InipQ3TXT3 104 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nxpe2Q3U095 558 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc177Q3UHB8 706 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd28Q505D1 1053 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp22Q5DU02 525 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nrsn2Q5HZK2 202 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1364Q5SZS9 314 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc30a1Q60738 503 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdkn2cQ60772 168 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Coq8aQ60936 645 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Il18r1Q61098 537 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NnatQ61979 81 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lpcat4Q6NVG1 524 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dtx4Q6PDK8 616 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cnih3Q6ZWS4 160 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf503Q7TMA2 652 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smap2Q7TN29 428 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr782Q7TRI2 314 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mfn2Q80U63 757 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hif1anQ8BLR9 349 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgap19Q8BRH3 494 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cxcl16Q8BSU2 246 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tgm4Q8BZH1 670 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps9d1Q8C190 649 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ska3Q8C263 411 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ifnl3Q8CGK6 193 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem125Q8CHQ6 216 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Noxa1Q8CJ00 444 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpat4Q8K2C8 456 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 St7lQ8K4P7 559 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GabrpQ8QZW7 440 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Irak4Q8R4K2 459 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc6a8Q8VBW1 640 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PpcsQ8VDG5 311 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Elac1Q8VEB6 362 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr437Q8VEV1 310 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr803Q8VFI3 308 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr691Q8VGW5 322 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 As3mtQ91WU5 376 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Diras1Q91Z61 198 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcl7bQ921K9 202 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mto1Q923Z3 669 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ndufa5Q9CPP6 116 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kdelr2Q9CQM2 212 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc25a30Q9CR58 291 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm18Q9CR83 190 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phf19Q9CXG9 578 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abcb8Q9CXJ4 717 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc77Q9CZH8 489 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Naalad2Q9CZR2 740 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aar2Q9D2V5 384 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NaaaQ9D7V9 362 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clca3a2Q9EQR4 902 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Riox1Q9JJF3 603 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tyk2Q9R117 1184 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AireQ9Z0E3 552 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NacaP70670 2187 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcnx3Q8VI59 2028 aa4.72□□□□□ -1.65
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6592A2AHC7 168 aa4.71□□□□□ -1.66
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Btbd35f28A2CFD5 498 aa4.71□□□□□ -1.66
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1700031F05RikB1AX30 191 aa4.71□□□□□ -1.66
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sult6b2B7ZWN4 290 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 72.3 ms