RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 SowahbQ8BZW2 760 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc123Q8CII2 336 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 HinfpQ8K1K9 503 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Babam2Q8K3W0 383 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sco2Q8VCL2 255 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chrdl2Q8VEA6 426 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 PnpoQ91XF0 261 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bcdin3dQ91YP1 285 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr642Q924X8 314 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa14.34□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 KalrnA2CG49 2964 aa14.33□□□□□ -0.11
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aadacl3A2A7Z8 408 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prr32A2AFE9 284 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rdh8D3Z6W3 317 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm17174M0QWQ9 212 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 BckdkO55028 412 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Creg1O88668 220 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sox6P40645 827 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mapk14P47811 360 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nos3P70313 1202 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 G6pd2P97324 513 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spata13Q5DU57 656 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klra2Q60660 288 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Camk2dQ6PHZ2 499 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr506Q7TRU6 314 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1261Q8VFB0 306 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr98Q8VFD9 309 aa14.33□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vps13cQ8BX70 3748 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 SetxA2AKX3 2646 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Urb1Q571H0 2274 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1493-ps1A0A140LHU2 316 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp712E9PXJ4 705 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr370E9Q848 314 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp988F6VKC7 633 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm16506F7ANP4 213 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp989H3BLB0 661 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21411J3KMS0 136 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Itln1O88310 313 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdk1P11440 297 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pou3f2P31360 445 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp987Q32P14 633 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ipcef1Q5DU31 406 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 St6gal1Q64685 403 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1281Q7TQY6 305 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr270Q7TS19 314 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam53bQ8BGR5 422 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 SynbQ8BI41 618 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 MetrnQ8C1Q4 291 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nsun3Q8CCT7 348 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adhfe1Q8R0N6 465 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 D1Ertd622eQ8VEB3 207 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr60Q8VGL4 311 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dcp1aQ91YD3 602 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 LhppQ9D7I5 270 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr934Q9EQ87 310 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ramp3Q9WUP1 147 aa14.32□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dgat2l6A2ADU8 337 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 CymB7ZWD6 379 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Muc3E9PWP7 378 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 H3BKT1 185 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Raet1aO08602 253 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Raet1bO08603 253 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hoxb6P09023 224 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Irf1P15314 329 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ctbp2P56546 445 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Crabp1P62965 137 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atf4Q06507 349 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp866Q6PGD2 520 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mab21l2Q8BPP1 359 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Peli1Q8C669 418 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmed9Q99KF1 235 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Utp23Q9CX11 249 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eif1bQ9CXU9 113 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ctag2Q9D9S4 219 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc35a2Q9R0M8 390 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rgs6Q9Z2H2 472 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mtg2A2AFK4 405 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1040A2ARY1 313 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zyg11aA2BFL2 627 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mllt6B1AR10 1109 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem92B7ZWI3 162 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rasd1O35626 280 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hprt1P00493 218 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc2a1P17809 492 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rab12P35283 243 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rac3P60764 192 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Acta2P62737 377 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Actg2P63268 376 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 MpgQ04841 333 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7030Q0WXH6 285 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Parp8Q3UD82 852 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc6a7Q6PGE7 637 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ahcyl1Q80SW1 530 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr446Q8VEV0 308 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 PlgrktQ9D3P8 147 aa14.31□□□□□ -0.12
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rtl8cQ9D6I0 112 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.6 ms