RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB112Q30KQ8 113 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD3OSQ6XYD6 125 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZR03 302 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM255BQ8WV15 326 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2FQ969M7 185 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2V2Q96R30 315 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP27Q9H306 513 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 POFUT1Q9H488 388 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 IL19Q9UHD0 177 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM178BH3BS89 294 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF205O95201 554 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT2P09544 360 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MTPNP58546 118 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R41P59536 307 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DHDDSQ86SQ9 333 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NKAIN4Q8IVV8 208 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10S1Q8NGN2 331 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TAMM41Q96BW9 452 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CMBLQ96DG6 245 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG12Q9BV10 488 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH7Q9H992 704 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf141Q9NUB4 165 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP16P51512 607 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 LAPTM4AQ15012 233 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DLEU7Q6UYE1 221 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 KLBQ86Z14 1044 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN22Q8N7P3 220 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NOTCH1P46531 2555 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf71A8MTZ7 269 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM23O14925 209 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM34P42696 430 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR5AP47898 357 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 IDH3AP50213 366 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SELPLGQ14242 412 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG10Q5BKT4 473 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 POU5F2Q8N7G0 328 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM239Q8WW34 195 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 EBF4Q9BQW3 602 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRM5B3KS81 715 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 KITLGP21583 273 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MSR1P21757 451 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PAX2Q02962 417 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC27A4Q6P1M0 643 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AS1Q8N127 324 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MIOXQ9UGB7 285 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPB13A6NJU9 1138 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPB4C9JG80 1138 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNL4K9M1U5 179 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 DOK2O60496 412 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR157Q5UAW9 335 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8B3Q8NGG8 313 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC8Q8TC99 324 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF5Q8WWW0 418 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB18Q96M61 343 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8B2Q96RD0 313 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CITED1Q99966 193 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GCM1Q9NP62 436 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C1RLQ9NZP8 487 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMCX1Q9P291 453 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MED31Q9Y3C7 131 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ERLIN1O75477 346 aa22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-217ENST00000629983 TUBG1P23258 451 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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CAPNS1-217ENST00000629983 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFN1Q86VF2 1251 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10AD1Q8NGE0 317 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CGREF1Q99674 301 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM165Q9HC07 324 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 EMC7Q9NPA0 242 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBG2Q9NRH3 451 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD10Q9Y365 291 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CLPSL1A2RUU4 121 aa22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF1BP20333 461 aa22.87■■□□□ 1.25
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