RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM82A0PJX8 343 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 HRKO00198 91 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TNFSF12O43508 249 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SIGLEC6O43699 453 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MOSPD3O75425 235 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 HTR3BO95264 441 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 EFEMP2O95967 443 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CISD3P0C7P0 127 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CD53P19397 219 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GNRHRP30968 328 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DLSTP36957 453 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GLP1RP43220 463 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DIO1P49895 249 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 EPHA4P54764 986 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CLRN1P58418 232 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ACTBP60709 375 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ACTG1P63261 375 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PLAURQ03405 335 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DPTQ07507 201 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZIC1Q15915 447 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 Q499Y3 187 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GALNT16Q8N428 558 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 JAM3Q9BX67 310 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FGF22Q9HCT0 170 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 APMAPQ9HDC9 416 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 GGT3PA6NGU5 568 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR6C76A6NM76 312 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 HMSDA8MTL9 139 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 H7C417 338 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 NDUFA2O43678 99 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CTSVO60911 334 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MPGP29372 298 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AGTR1P30556 359 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FGL1Q08830 312 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 IKZF1Q13422 519 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 NANPQ8TBE9 248 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PGAM5Q96HS1 289 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 C10orf90Q96M02 699 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 HRH4Q9H3N8 390 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RGCCQ9H4X1 137 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 A0A0B4J2A0 478 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 POM121BA6NF01 834 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC16A7O60669 478 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AK1P00568 194 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 IL5P05113 134 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 AKAIN1P0CW23 69 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SFTPDP35247 375 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC26A5P58743 744 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FXYD4P59646 89 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR13H1Q8NG92 308 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TMED6Q8WW62 240 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 DCUN1D4Q92564 292 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 PRR13Q9NZ81 148 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD9-216ENST00000620854 EMC3Q9P0I2 261 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms