RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	GGH	Q92820	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	MNT	Q99583	582 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB36	O95755	333 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	LYN	P07948	512 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	CRHBP	P24387	322 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	ARR3	P36575	388 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC15A1	P46059	708 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	SORD	Q00796	357 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	COPS4	Q9BT78	406 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-222	ENST00000598256	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	PHYH	O14832	338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	RER1	O15258	196 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	SGCE	O43556	437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	DOK2	O60496	412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP3CB	P16298	524 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	MYL12A	P19105	171 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	CHN2	P52757	468 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	HCCS	P53701	268 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB1A	P62820	205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	PLP2	Q04941	152 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	TFF3	Q07654	80 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	PPA1	Q15181	289 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	TAB1	Q15750	504 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	PCK2	Q16822	640 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	MDP1	Q86V88	176 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM80	Q96HE8	168 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	NOX3	Q9HBY0	568 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	IGHA1	P01876	353 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF224	P0DH78	156 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	DCK	P27707	260 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC35A2	P78381	396 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB35	Q15286	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-222	ENST00000598256	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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