RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		Q5BKY6	102 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ARTN	Q5T4W7	220 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CA13	Q8N1Q1	262 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF511	Q8NB15	262 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C3orf49	Q96BT1	292 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	S100PBP	Q96BU1	408 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PEX11G	Q96HA9	241 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GPA33	Q99795	319 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	HRH4	Q9H3N8	390 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PSMD9	O00233	223 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FGF17	O60258	216 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MPIG6B	O95866	241 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MT-ND4L	P03901	98 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CISD3	P0C7P0	127 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FAM157B	P0CG42	384 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC2A5	P22732	501 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MSX1	P28360	303 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RFC3	P40938	356 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CASR	P41180	1078 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MEOX2	P50222	304 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DHRS2	Q13268	280 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SGCB	Q16585	318 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF74	Q16587	644 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM225	Q6GV28	225 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR52N5	Q8NH56	324 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SPTSSA	Q969W0	71 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GPR174	Q9BXC1	333 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1B0GWJ7	208 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PPV9	198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PRSS37	A4D1T9	235 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LRP5L	A4QPB2	252 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		H0YIG0	161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		M0QYG6	137 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TNFSF14	O43557	240 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GPR137B	O60478	399 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CLN5	O75503	358 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	UTS2	O95399	124 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	HP	P00738	406 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CST4	P01036	141 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	IGHG1	P01857	330 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GP1BA	P07359	652 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MELTF	P08582	738 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FST	P19883	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DRD1	P21728	446 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FPR2	P25090	351 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	THBS2	P35442	1172 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF136	P52737	540 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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