RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ERLIN1	O75477	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	CLPX	O76031	633 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	FSTL3	O95633	263 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	FUT1	P19526	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	VSNL1	P62760	191 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NSMAF	Q92636	917 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TNNI3-208	ENST00000589864	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864		M0QX08	132 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ALX3	O95076	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ABHD16A	O95870	558 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MT-ND1	P03886	318 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	LAP3	P28838	519 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	AQP2	P41181	271 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MMP16	P51512	607 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FMOD	Q06828	376 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CD47	Q08722	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CMBL	Q96DG6	245 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OR2V2	Q96R30	315 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OR7A10	O76100	309 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	IGF2	P01344	180 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MELTF	P08582	738 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	COX5B	P10606	129 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	STX1B	P61266	288 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FGF12	P61328	243 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TTMP	Q5BVD1	217 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	DYRK2	Q92630	601 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	COG8	Q96MW5	612 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RBP7	Q96R05	134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	THRB	P10828	461 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	CD247	P20963	164 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PROK1	P58294	105 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	FITM2	Q8N6M3	262 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	OPN1SW	P03999	348 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MSR1	P21757	451 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	PITPNB	P48739	271 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	MREG	Q8N565	214 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TNNI3-208	ENST00000589864	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.67	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms