RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580004.1

NEK4P2-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NEK4P2, Length 1,012 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P2-201ENST00000580004 Q96MF0 132 aa16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 TSSK2Q96PF2 358 aa16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ACANP16112 2415 aa16.09■□□□□ 0.17
NEK4P2-201ENST00000580004 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TMEM129A0AVI4 362 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 C5orf49A4QMS7 147 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 H3BN98 237 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 J3QW42 95 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SYNGR3O43761 229 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GPRIN2O60269 458 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF250P15622 560 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF3P17036 446 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC25A1P53007 311 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ACTR3P61158 418 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CLEC12BQ2HXU8 276 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF774Q6NX45 483 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FAHD1Q6P587 224 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PARP8Q8N3A8 854 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OR4Q3Q8NH05 313 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TEX12Q9BXU0 123 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 RAB1BQ9H0U4 201 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MS4A5Q9H3V2 200 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GPR160Q9UJ42 338 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 DOK2O60496 412 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CCL2P13500 99 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ERFP50548 548 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 NUDT6P53370 316 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TEKQ02763 1124 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MOGQ16653 247 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SVOPLQ8N434 492 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 C18orf12Q96KH6 178 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 COG8Q96MW5 612 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OR6C6A6NF89 314 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 M0R233 179 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MPZL1O95297 269 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 HMGN1P05114 100 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FAM157BP0CG42 384 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CCNOP22674 350 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 HTR5AP47898 357 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CDK5Q00535 292 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CRMP1Q14194 572 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 C4orf45Q96LM5 186 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 COQ7Q99807 217 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.06■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 G3V2T6 193 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 NDUFS7O75251 213 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TFP02787 698 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 LCKP06239 509 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PRKACGP22612 351 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 WNT5AP41221 380 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 RGS6P49758 472 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ESRRGP62508 458 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ECH1Q13011 328 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CLEC2AQ6UVW9 174 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OR1J1Q8NGS3 322 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 OR1F12Q8NHA8 337 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.05■□□□□ 0.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms