RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDAH2O95865 285 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 DPY19L4Q7Z388 723 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC25A45Q8N413 288 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAL3ST4Q96RP7 486 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 INTS14Q96SY0 518 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 COMMD4Q9H0A8 199 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYT4Q9H2B2 425 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASL12Q9NYN1 266 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 GMFGO60234 142 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 BGLAPP02818 100 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF883P0CG24 379 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MGMTP16455 207 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PXT1Q8NFP0 134 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM212A6NML5 194 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HCRTR2O43614 444 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBBP9O75884 186 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF35P13682 527 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXCR1P25024 350 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CSF2RBP32927 897 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPS27P42677 84 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 NKAIN2Q5VXU1 208 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MOB3CQ70IA8 216 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT77Q7Z794 578 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMPRSS12Q86WS5 348 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF676Q8N7Q3 588 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEFB124Q8NES8 71 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCDC2BA2VCK2 349 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 POM121CA8CG34 1229 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPB2A8KAH6 182 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 H3BMH7 237 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHYHO14832 338 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPANK1O95872 356 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTHLHP12272 177 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL12BP29460 328 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPB2Q16082 182 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 C2orf68Q2NKX9 166 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRSS35Q8N3Z0 413 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR10AC1Q8NH08 325 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF417Q8TAU3 575 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZDHHC12Q96GR4 267 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUDT9Q9BW91 350 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 NRSN2Q9GZP1 204 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0D9SG52 128 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 H3BUI4 141 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TM4SF5O14894 197 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 YKT6O15498 198 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAS1P04201 325 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGTR1P30556 359 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 B2MP61769 119 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 DCAF7P61962 342 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF345Q14585 488 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYND11Q15326 602 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 POMZP3Q6PJE2 187 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATRAIDQ6UW56 229 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR4C16Q8NGL9 310 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR148Q8TDV2 347 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 GINS4Q9BRT9 223 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB33BQ9H082 229 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 FXYD6Q9H0Q3 95 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC14CA4D256 554 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD8AP01732 235 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITPKBP27987 946 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 EBPQ15125 230 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TOMM20Q15388 145 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEFB133Q30KQ1 61 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAAP20Q6NZ36 180 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MARCH3Q86UD3 253 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR51A4Q8NGJ6 313 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 OTOSQ8NHW6 89 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM106AQ96A25 262 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHYHIPLQ96FC7 376 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMELYQ99218 206 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 MFFQ9GZY8 342 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms