RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-215ENST00000557654 LOC285556D6RIA3 1793 aa3.51□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 FAM25EA8MYX2 175 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 SLC28A1O00337 649 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 PIRO00625 290 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 TOR1AO14656 332 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 MYL12BO14950 172 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 PLA2G10O15496 165 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 SNAPC5O75971 98 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 FABP3P05413 133 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 CSF3P09919 207 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 SLC2A3P11169 496 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ANXA8P13928 327 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 MYL12AP19105 171 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 TNFRSF4P43489 277 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 ADIGQ0VDE8 80 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 SSX1Q16384 188 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 AANATQ16613 207 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ACER2Q5QJU3 275 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 HECTD3Q5T447 861 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 SAXO2Q658L1 398 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 PAQR9Q6ZVX9 377 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 ARMCX2Q7L311 632 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 STX19Q8N4C7 294 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ATPAF2Q8N5M1 289 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 OR52K2Q8NGK3 314 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ENKURQ8TC29 256 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ITCHQ96J02 903 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 SPG21Q9NZD8 308 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 GLS2Q9UI32 602 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ALG5Q9Y673 324 aa3.5□□□□□ -1.85
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GPHN-215ENST00000557654 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 C7orf66A4D0T2 115 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 SUPT3HB4E1H0 165 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 E5RI56 91 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 SGK494L7N484 410 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 AKR7A2O43488 359 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 ORC5O43913 435 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 OTCP00480 354 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 IFNA7P01567 189 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 IGLV3-25P01717 112 aa3.49□□□□□ -1.85
GPHN-215ENST00000557654 STSP08842 583 aa3.49□□□□□ -1.85
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