RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CR1	P17927	2039 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549		G3V2T6	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	DCTN6	O00399	190 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SOX14	O95416	240 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	HEXA	P06865	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	GAA	P10253	952 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF3	P17036	446 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	TUBG1	P23258	451 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	ESRRG	P62508	458 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CDK5	Q00535	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	ARL9	Q6T311	187 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	GJC3	Q8NFK1	279 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RERGL	Q9H628	205 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549		H3BSA7	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SGCE	O43556	437 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SCG5	P05408	212 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	OR4A8	P0C604	315 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF23	P17027	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PRKACG	P22612	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	THBS4	P35443	961 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	UCP2	P55851	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RAB35	Q15286	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	TSSK2	Q96PF2	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	EMC7	Q9NPA0	242 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549		J3QW42	95 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	DOK2	O60496	412 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	LY6H	O94772	140 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PPOX	P50336	477 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	DAP	P51397	102 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CRISP1	P54107	249 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	SELENOV	P59797	346 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	TEK	Q02763	1124 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	ECH1	Q13011	328 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	CRMP1	Q14194	572 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	GINS1	Q14691	196 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	MOG	Q16653	247 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	KRT80	Q6KB66	452 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RBM23-231	ENST00000557549	COG8	Q96MW5	612 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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