RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555668.5

GPHN-210, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-210ENST00000555668 FAM110BQ8TC76 370 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SMPDL3BQ92485 455 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 PIGBQ92521 554 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 DNASE1L2Q92874 299 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 REEP6Q96HR9 211 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 RAX2Q96IS3 184 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SLC35E1Q96K37 410 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 MGLLQ99685 303 aa3.66□□□□□ -1.82
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GPHN-210ENST00000555668 MYOCQ99972 504 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SEMA3CQ99985 751 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 HINT2Q9BX68 163 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 CDT1Q9H211 546 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SRMSQ9H3Y6 488 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 MMP25Q9NPA2 562 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 ASF1BQ9NVP2 202 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 PADI3Q9ULW8 664 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 ALPK3Q96L96 1907 aa3.66□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa3.65□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 SBF1O95248 1867 aa3.65□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 CACNA1SQ13698 1873 aa3.65□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
GPHN-210ENST00000555668 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 GGT3PA6NGU5 568 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 YDJCA8MPS7 323 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-210ENST00000555668 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 SULT2B1O00204 365 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-210ENST00000555668 RAD51DO75771 328 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-210ENST00000555668 BDKRB1P46663 353 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-210ENST00000555668 LGALS7P47929 136 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 FLT3LGP49771 235 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-210ENST00000555668 AKR1C2P52895 323 aa3.65□□□□□ -1.83
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GPHN-210ENST00000555668 ZNF235Q14590 738 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 TPSAB1Q15661 275 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 UBE2V2Q15819 145 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 CSRP2Q16527 193 aa3.65□□□□□ -1.83
GPHN-210ENST00000555668 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.65□□□□□ -1.83
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