RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 ADH4P08319 380 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 BTG1P62324 171 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SELENOWP63302 87 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SCRN3Q0VDG4 424 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FOXL1Q12952 345 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF154Q13106 437 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 BAMBIQ13145 260 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 CDK5R2Q13319 367 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 MAPRE2Q15555 327 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 NPEPL1Q8NDH3 523 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 DEFB108BQ8NET1 73 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2T12Q8NG77 320 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 OR13C2Q8NGS9 318 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 LZICQ8WZA0 190 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 CMBLQ96DG6 245 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SAMD8Q96LT4 415 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 POFUT1Q9H488 388 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 POLE4Q9NR33 117 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 GID8Q9NWU2 228 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa10.24□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIAL4EA0A075B759 164 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 BBIP1A8MTZ0 92 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM220BPB1ANY3 271 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIAL4DF5H284 164 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 J3KTA2 159 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FXYD1O00168 92 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SURF4O15260 269 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF682O95780 498 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 NPPAP01160 153 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FSHBP01225 129 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 IFNW1P05000 195 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIAL4FP0DN26 164 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FUT4P22083 530 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR4P46093 362 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC6A9P48067 706 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC9A3P48764 834 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 TRAM2Q15035 370 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ESCO2Q56NI9 601 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 COQ5Q5HYK3 327 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 OTPQ5XKR4 325 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF730Q6ZMV8 503 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 RRM2BQ7LG56 351 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SYT9Q86SS6 491 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 OR5AS1Q8N127 324 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ITLN1Q8WWA0 313 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2V2Q96R30 315 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 GPA33Q99795 319 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PLEK2Q9NYT0 353 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF69Q9UC07 566 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.23□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SGCEO43556 437 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ICMTO60725 284 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF205O95201 554 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 HKR1P10072 659 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PRTN3P24158 256 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 GUCY1A3Q02108 690 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 PRKCDQ05655 676 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 KLF10Q13118 480 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZMYND11Q15326 602 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 Q6ZR03 302 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF283Q8N7M2 679 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC7A6Q92536 515 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF570Q96NI8 536 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF747Q9BV97 191 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 MRGBPQ9NV56 204 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 IL19Q9UHD0 177 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 STARD10Q9Y365 291 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 INSIG2Q9Y5U4 225 aa10.22□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.21□□□□□ -0.77
CTDSP2-205ENST00000549039 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms