RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 HSF1Q00613 529 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GUCA2BQ16661 112 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FCRLAQ7L513 359 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM129CQ86XR2 697 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GALNT16Q8N428 558 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SPSB2Q99619 263 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GABRG3Q99928 467 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MS4A8Q9BY19 250 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FZD3Q9NPG1 666 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 FBP1P09467 338 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 HBG2P69892 147 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TSSK2Q96PF2 358 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MENTQ9BUN1 341 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 STK17BO94768 372 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 OR2T27Q8NH04 317 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 BANF2Q9H503 90 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZRG5 221 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 MTCP1P56278 107 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 VITQ6UXI7 678 aa5.53□□□□□ -1.52
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