RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 APRTP07741 180 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 FBP1P09467 338 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RD3LP0DJH9 198 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ADRB3P13945 408 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 UQCRC2P22695 453 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 GABRR1P24046 479 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 DCKP27707 260 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ERP29P30040 261 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 FCGR2CP31995 323 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PRDX2P32119 198 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 ACVR1BP36896 505 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 CRYBB2P43320 205 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 GYG1P46976 350 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SLC6A8P48029 635 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 HCAR3P49019 387 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PPOXP50336 477 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TNFSF10P50591 281 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RPL14P50914 215 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 ATP5J2P56134 94 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 CDC42P60953 191 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PJVKQ0ZLH3 352 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 NME3Q13232 169 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 OR2A2Q6IF42 318 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 OR5L1Q8NGL2 311 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR9A4Q8NGU2 314 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 SYT4Q9H2B2 425 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 C1orf109Q9NX04 203 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 BABAM2Q9NXR7 383 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 MLXQ9UH92 298 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR52A1Q9UKL2 312 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 MGAT4AQ9UM21 535 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 MEMO1Q9Y316 297 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR51B4Q9Y5P0 310 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ZFYVE9O95405 1425 aa2.73□□□□□ -1.97
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