RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.065e-8■■■■□ 21.4
PACS1-209ENST00000529757 STK11Q15831 433 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 TUBA1AQ71U36 451 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACS1-209ENST00000529757 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACS1-209ENST00000529757 SIAEQ9HAT2 523 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CENPMQ9NSP4 180 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACS1-209ENST00000529757 OPRL1P41146 370 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 C22orf42Q6IC83 251 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 FDX2Q6P4F2 183 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 FOXB1Q99853 325 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 UPB1Q9UBR1 384 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 CD8B2A6NJW9 211 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNF878C9JN71 531 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 SERPINA3P01011 423 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 CD8BP10966 210 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNF544Q6NX49 715 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.63□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ABHD4Q8TB40 342 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 KCTD7Q96MP8 289 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 RER1O15258 196 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 CST2P09228 141 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 GABRA1P14867 456 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 B4GALT1P15291 398 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 TEX19Q8NA77 164 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 GJC3Q8NFK1 279 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 C4orf45Q96LM5 186 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 C12orf49Q9H741 205 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 GALNT8Q9NY28 637 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 R4GMQ9 66 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 WDR1O75083 606 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZFPL1O95159 310 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 TPOP07202 933 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 PTGER4P35408 488 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 CCR9P51686 369 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 INSL4Q14641 139 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 TAF13Q15543 124 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 DGUOKQ16854 277 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 NRN1LQ496H8 165 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 OR5AK2Q8NH90 309 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 TDGF1P3P51864 188 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 HIST1H3AP68431 136 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-209ENST00000529757 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ACSM3Q53FZ2 586 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 WDR38Q5JTN6 314 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-209ENST00000529757 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.61□□□□□ -0.07
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