RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 C7orf66A4D0T2 115 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 A8MXQ7 604 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 BTN3A3O00478 584 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 XKRYO14609 159 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 IQCF3P0C7M6 154 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 GOLGA8HP0CJ92 632 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 PNMTP11086 282 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CA8P35219 290 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 DDOSTP39656 456 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 TNFRSF17Q02223 184 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL30Q0D2K2 578 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 SELPLGQ14242 412 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 FZD2Q14332 565 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 DMRTC1Q5HYR2 192 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CES3Q6UWW8 571 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 LYPD2Q6UXB3 125 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC80Q76M96 950 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 MYOCDQ8IZQ8 938 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 IPMKQ8NFU5 416 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 OR4D5Q8NGN0 318 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CAPS2Q9BXY5 557 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 GBA3Q9H227 469 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 TMCO1Q9UM00 188 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 MEMO1Q9Y316 297 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 PTPRBP23467 1997 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 THADAQ6YHU6 1953 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CACNA1EQ15878 2313 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 WDR19Q8NEZ3 1342 aa2.17□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CIB4A0PJX0 185 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 HAS3O00219 553 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ADRA2AP08913 450 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 EPB41P11171 864 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ATP6V1C1P21283 382 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 IL12AP29459 219 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CASP4P49662 377 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 PLD1Q13393 1074 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 MESDQ14696 234 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 DUSP7Q16829 419 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM31Q5JXX7 168 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 FBXW9Q5XUX1 488 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 SYT14Q8NB59 555 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 VN1R2Q8NFZ6 395 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 UFD1Q92890 307 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 SMARCD2Q92925 531 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 COQ10BQ9H8M1 238 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CALYQ9NYX4 217 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 CHRNA9Q9UGM1 479 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 Q9Y3F1 56 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 KIF3AQ9Y496 699 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 WIF1Q9Y5W5 379 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 MYLKQ15746 1914 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ABCB11O95342 1321 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 TTC41PQ6P2S7 1318 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 ACACAQ13085 2346 aa2.16□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.15□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa2.15□□□□□ -2.06
CPEB4-210ENST00000522344 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 ITPR1Q14643 2758 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 INS-IGF2F8WCM5 200 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CYTH3O43739 400 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 HMMRO75330 724 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 DIRAS1O95057 198 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 VAMP5O95183 116 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 RCBTB2O95199 551 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 BGLAPP02818 100 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TCN2P20062 427 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 MX1P20591 662 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf61Q13536 156 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 HSDL1Q3SXM5 330 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 TCEAL5Q5H9L2 206 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 CNIH2Q6PI25 160 aa2.15□□□□□ -2.07
CPEB4-210ENST00000522344 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms