RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0A6YYH2	397 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GV72	72 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF222	A6NCQ9	220 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		A6NJ64	397 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF724	A8MTY0	619 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BQ15	152 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP3	P08254	477 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOD3	P08294	240 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2T7	P0C7T2	308 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNE1	P15382	129 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TACR3	P29371	465 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SGSH	P51688	502 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXK2	Q01167	660 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2T27	Q8NH04	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBX15	Q96SF7	602 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHST8	Q9H2A9	424 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FKRP	Q9H9S5	495 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAGK	Q9UJ70	344 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6A2	O95222	327 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERPINA7	P05543	415 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCAR	P24071	287 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GABRA2	P47869	451 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	LILRA4	P59901	499 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2G2	P60604	165 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q499Y3	187 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF774	Q6NX45	483 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	EXD3	Q8N9H8	876 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHST13	Q8NET6	341 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM8	Q96KF7	97 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF558	Q96NG5	402 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR7D2	Q96RA2	312 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAGEH1	Q9H213	219 aa		7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WUU8	490 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PN81	502 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAMEF11	O60813	436 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2J2	O76002	312 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DQA2	P01906	255 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IQCF3	P0C7M6	154 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTN	P21246	168 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRNA7	P36544	502 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LIMS1	P48059	325 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK1D	P48730	415 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OAZ1	P54368	228 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL6IP1	Q15041	203 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6K	Q17RY6	165 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF175	Q8N4F7	328 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR148	Q8TDV2	347 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFRSF14	Q92956	283 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CMKLR1	Q99788	373 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHST6	Q9GZX3	395 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHST11	Q9NPF2	352 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GVT2	93 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf226	A1L170	272 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR32	O75388	356 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGA4	P0DJD7	388 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGA5	P0DJD9	388 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HKR1	P10072	659 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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