RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FCRL5Q96RD9 977 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NODALQ96S42 347 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PAFAH2Q99487 392 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BARHL1Q9BZE3 327 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CST9LQ9H4G1 147 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CALHM2Q9HA72 323 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ACP6Q9NPH0 428 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A9Q9NRM0 540 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 STARD5Q9NSY2 213 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GLOD5A6NK44 160 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AQP7P3A6NL99 342 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 K7ERU9 68 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AQP7O14520 342 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC16A8O95907 504 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HGFP14210 728 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1C4P17516 323 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 RGS4P49798 205 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 UNC50Q53HI1 259 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SPIN3Q5JUX0 258 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2FQ969M7 185 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM10Q96HG1 83 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 REEP6Q96HR9 211 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IP6K3Q96PC2 410 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF350Q9GZX5 532 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EYSQ5T1H1 3165 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 CDC14CA4D256 554 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2W5A6NFC9 320 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR11H12B2RN74 326 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC19A2O60779 497 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SFTPBP07988 381 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2ADP20671 130 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK3Q00526 305 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RBBP4Q09028 425 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C4orf17Q53FE4 359 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR11H1Q8NG94 326 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR11H2Q8NH07 326 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 P2RY11Q96G91 374 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 MS4A4EQ96PG1 132 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52E6Q96RD3 313 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGGTB-213ENST00000496055 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF22Q9HCT0 170 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LHX3Q9UBR4 397 aa4.11□□□□□ -1.75
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