RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SYT9Q86SS6 491 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC7A6Q92536 515 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 HPS1Q92902 700 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf159Q96HA4 380 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 C4orf45Q96LM5 186 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 TSSK2Q96PF2 358 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 BEX2Q9BXY8 128 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 NUAK2Q9H093 628 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 OR52D1Q9H346 318 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 RERGLQ9H628 205 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 NDE1Q9NXR1 346 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CACNG2Q9Y698 323 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 OR6C6A6NF89 314 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM157AC9JC47 383 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SGCEO43556 437 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SPRY3O43610 288 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ABHD16AO95870 558 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV1-46P01743 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 GCH1P30793 250 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 MAGEA2P43356 314 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 GSSP48637 474 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ERFP50548 548 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF81P51508 661 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 RPS6KA3P51812 740 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SMIM11AP58511 58 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 AQP6Q13520 282 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 MEP1BQ16820 701 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CR1LQ2VPA4 569 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 RFX4Q33E94 735 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SPRNQ5BIV9 151 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 AVPI1Q5T686 147 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 LEG1Q6P5S2 330 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 USP51Q70EK9 711 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SAMD8Q96LT4 415 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 NMNAT3Q96T66 252 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 FN3KQ9H479 309 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 PLEK2Q9NYT0 353 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 GPR160Q9UJ42 338 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.05□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 B2RBV5 119 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 H3BSA7 217 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 RER1O15258 196 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM107AO95990 144 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 IFNA2P01563 188 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 DBHP09172 617 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 T-ENOLP0DO92 83 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 COX5BP10606 129 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SRD5A1P18405 259 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC6A6P31641 620 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CRYBB2P43320 205 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 PSG7Q13046 419 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 SPATS1Q496A3 300 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 LCN8Q6JVE9 175 aa7.04□□□□□ -1.28
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms