RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 COX15Q7KZN9 410 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OAFQ86UD1 273 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF575Q86XF7 245 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ADGRG3Q86Y34 549 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 GID4Q8IVV7 300 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PRSS58Q8IYP2 241 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PRR22Q8IZ63 422 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 SLC34A3Q8N130 599 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 SLC43A2Q8N370 569 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CADM2Q8N3J6 435 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF321PQ8N8H1 164 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM105Q8N8V8 129 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 GATSQ8NAP1 163 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR2T33Q8NG76 320 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR13C2Q8NGS9 318 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR4Q3Q8NH05 313 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PFN4Q8NHR9 129 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF721Q8TF20 911 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC107Q8WV48 283 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 YIPF6Q96EC8 236 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF503Q96F45 646 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 LRR1Q96L50 414 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 SAMD8Q96LT4 415 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 LRFN5Q96NI6 719 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 GPA33Q99795 319 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 NUDT9Q9BW91 350 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 MND1Q9BWT6 205 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TSSK6Q9BXA6 273 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CDCA4Q9BXL8 241 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 NDEL1Q9GZM8 345 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 WWTR1Q9GZV5 400 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR52D1Q9H346 318 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 DPAGT1Q9H3H5 408 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 DSN1Q9H410 356 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 AMBNQ9NP70 447 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 MMP25Q9NPA2 562 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 UBQLN4Q9NRR5 601 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 IL20Q9NYY1 176 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CTSFQ9UBX1 484 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 BAIAP2Q9UQB8 552 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.54□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 A0A087WUJ7 227 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 A0A1W2PQD3 144 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM129A0AVI4 362 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 LINC01548A6NM66 108 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 IDSB3KWA1 339 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 C9J4A7 227 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 MS4A18H0YCH9 400 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 J3QR06 171 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CCRL2O00421 344 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 BHLHE40O14503 412 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CDC42EP2O14613 210 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TO15178 435 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 FLRT2O43155 660 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 XRCC3O43542 346 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PLPP2O43688 288 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 SCO2O43819 266 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 AIREO43918 545 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 TSPAN2O60636 221 aa2.53□□□□□ -2
SMYD3-215ENST00000490322 FCGR3BO75015 233 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms