RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483282.1

C1orf43-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf43, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-208ENST00000483282 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RAB4AP20338 218 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MAGEB1P43366 347 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TNFRSF4P43489 277 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 FNTBP49356 437 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 UCP2P55851 309 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 DLK1P80370 383 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 DEFA6Q01524 100 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ZP4Q12836 540 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SGCAQ16586 387 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 KLHL26Q53HC5 615 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 AGBL4Q5VU57 503 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RNF44Q7L0R7 432 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 HOGA1Q86XE5 327 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 CACUL1Q86Y37 369 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MVB12AQ96EY5 273 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 DGAT2Q96PD7 388 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SPIN2AQ99865 258 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 UCK1Q9HA47 277 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 INSL6Q9Y581 213 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.55□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 A0A0J9YY10 115 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 A0A1W2PPC1 479 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM72A0PK05 275 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 PRSS37A4D1T9 235 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 H0YIG0 161 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 K7EPK0 472 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 LGALS8O00214 317 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 CYR61O00622 381 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 EFSO43281 561 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MBTPS2O43462 519 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SOX15O60248 233 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 PRF1P14222 555 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MMP9P14780 707 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 FOSL2P15408 326 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 VAMP1P23763 118 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ALDH3B1P43353 468 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 BLKP51451 505 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MTCP1P56278 107 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 FUT7Q11130 342 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 IL13RA2Q14627 380 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 CST6Q15828 149 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 PCK2Q16822 640 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 TMEM215Q68D42 235 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR4K15Q8NH41 348 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 OR52N5Q8NH56 324 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 GRHL3Q8TE85 626 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 KLK6Q92876 244 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 RAB24Q969Q5 203 aa7.54□□□□□ -1.2
C1orf43-208ENST00000483282 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms