RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 VAX2Q9UIW0 290 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NME7Q9Y5B8 376 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DAPL1A0PJW8 107 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SMIM30A4D0T7 59 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MGAT4DA6NG13 374 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF726A6NNF4 738 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 K7ERQ8 282 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CYR61O00622 381 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF208O43345 1280 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF432O94892 652 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SOX14O95416 240 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MPIG6BO95866 241 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TK1P04183 234 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 KCNE1P15382 129 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TACR3P29371 465 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 IL2RGP31785 369 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 BMI1P35226 326 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ARR3P36575 388 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NDUFA6P56556 154 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R38P59533 333 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TAS2R31P59538 309 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ARF6P62330 175 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 EGR3Q06889 387 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MEF2DQ14814 521 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RAB35Q15286 201 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RPE65Q16518 533 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 KCNMB1Q16558 191 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 IQCJQ1A5X6 159 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PGGHGQ32M88 737 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MPPE1Q53F39 396 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ARTNQ5T4W7 220 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF529Q6P280 563 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR2L3Q8NG85 312 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MITD1Q8WV92 249 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 RAB39BQ96DA2 213 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SMIM19Q96E16 107 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 NEURL3Q96EH8 262 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 C5orf34Q96MH7 638 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZNF75AQ96N20 296 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PHB2Q99623 299 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SLITRK2Q9H156 845 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 BEX1Q9HBH7 125 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 MYNNQ9NPC7 610 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 DKKL1Q9UK85 242 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 ARL5AQ9Y689 179 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 VWA8A3KMH1 1905 aa6.46□□□□□ -1.37
PKP4-211ENST00000481115 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ARL5CA6NH57 179 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HSPB2A8KAH6 182 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PTGESO14684 152 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CYTIPO60759 359 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FMO6PO60774 539 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRAMEF11O60813 436 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 JTBO76095 146 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ACTL6BO94805 426 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 YIF1AO95070 293 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR2C1O95371 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AHSA1O95433 338 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CST4P01036 141 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LINC00271P0C7V0 271 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TBPP20226 339 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CD34P28906 385 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MPIP34949 423 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AHRP35869 848 aa6.46□□□□□ -1.38
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