RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 GUCA2BQ16661 112 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CST9LP1Q5W188 147 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 FRG2Q64ET8 278 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 PLET1Q6UQ28 207 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2M7Q8NG81 312 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 PSMF1Q92530 271 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ERGIC1Q969X5 290 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SFXN2Q96NB2 322 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 FRG2BQ96QU4 278 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 STACQ99469 402 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 MDFIQ99750 246 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 NANOGQ9H9S0 305 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 AHSPQ9NZD4 102 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ABI3Q9P2A4 366 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 DAPP1Q9UN19 280 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 STUB1Q9UNE7 303 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 MEMO1Q9Y316 297 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A0A6YYD5 115 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PNV4 684 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC35F4A4IF30 521 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 HRKO00198 91 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 HS3ST1O14792 307 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 BCKDKO14874 412 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF13O43567 381 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 TMPRSS11DO60235 418 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 RAMP3O60896 148 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SH3BGRLO75368 114 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CYP7B1O75881 506 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SEC14L2O76054 403 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4F21O95013 312 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 TGFB1P01137 390 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 C1QBP02746 253 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 BPGMP07738 259 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 MAOAP21397 527 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 BGNP21810 368 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 MYF6P23409 242 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SSR2P43308 183 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 GZMKP49863 264 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 HTR6P50406 440 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CDH11P55287 796 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 LIM2P55344 173 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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RPUSD3-212ENST00000466141 SLAMF1Q13291 335 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SFT2D3Q587I9 215 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 AVPI1Q5T686 147 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 LIPMQ5VYY2 423 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.55□□□□□ -1.36
RPUSD3-212ENST00000466141 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.55□□□□□ -1.36
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