RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 STX1BP61266 288 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 FMODQ06828 376 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 FAM27BQ5VT28 67 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 C10orf111Q8N326 155 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 TMEM86BQ8N661 226 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 OR6T1Q8NGN1 323 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 ZBTB9Q96C00 473 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 RBP7Q96R05 134 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 TMEM165Q9HC07 324 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 SLAMF8Q9P0V8 285 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.91□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 GMNCA6NCL1 334 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 IFNL4K9M1U5 179 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 M0QX08 132 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 MELTFP08582 738 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 NR2C1P13056 603 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 FUT1P19526 365 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 CPT2P23786 658 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 PITPNBP48739 271 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 UGT2B15P54855 530 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 BPIFB3P59826 476 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 PAX2Q02962 417 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 MPP2Q14168 576 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 Q6ZR03 302 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 OR5AS1Q8N127 324 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 LINC01006Q8NI28 216 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 NABP1Q96AH0 204 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 MPP4Q96JB8 637 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 OR52B2Q96RD2 323 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 GCM1Q9NP62 436 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 CLN8Q9UBY8 286 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.9□□□□□ -0.5
CENPF-202ENST00000464322 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 A0A1W2PPL8 197 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 LRRC30A6NM36 301 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 CST2P09228 141 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 NPTX1Q15818 432 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 DUSP7Q16829 419 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 MSRB3Q8IXL7 192 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 DYRK2Q92630 601 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 POFUT1Q9H488 388 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 VAPAQ9P0L0 249 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 POMT1Q9Y6A1 747 aa11.89□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 PIN1P1O15428 100 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 GPR137BO60478 399 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 THY1P04216 161 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 CSF1P09603 554 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 CD247P20963 164 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 KITLGP21583 273 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 HTR5AP47898 357 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 GUCY1A3Q02108 690 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 LAPTM4AQ15012 233 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 PTOV1Q86YD1 416 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 FITM2Q8N6M3 262 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SLC26A7Q8TE54 656 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 PTP4A1Q93096 173 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 HAVCR1Q96D42 359 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SGTBQ96EQ0 304 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 SEPHS2Q99611 448 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 STARD10Q9Y365 291 aa11.88□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 PIP5K1CO60331 668 aa11.87□□□□□ -0.51
CENPF-202ENST00000464322 CLPXO76031 633 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms