RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 H7C1C5 153 aa8.65□□□□□ -1.02
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DDX39B-211ENST00000449757 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 PKP2Q99959 881 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 GCM1Q9NP62 436 aa8.63□□□□□ -1.03
DDX39B-211ENST00000449757 POLE4Q9NR33 117 aa8.63□□□□□ -1.03
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