RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 RACGAP1Q9H0H5 632 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 PROK2Q9HC23 129 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FANCFQ9NPI8 374 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 GPR83Q9NYM4 423 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 LRFN1Q9P244 771 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ERVK-18Q9QC07 812 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 AASSQ9UDR5 926 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 VDAC3Q9Y277 283 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.08□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MED13Q9UHV7 2174 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 GJE1A6NN92 205 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 C17orf51A8MQB3 221 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 B4DXG7 233 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 M0R129 80 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 SEC14L5O43304 696 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 SEC14L2O76054 403 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 OR6A2O95222 327 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 RAB36O95755 333 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 IGHMP01871 453 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MT-ND2P03891 347 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 PRSS2P07478 247 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 STSP08842 583 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CCNA2P20248 432 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 GRPRP30550 384 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 AQP2P41181 271 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 NUDT6P53370 316 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CDH11P55287 796 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 DSCR9P59020 149 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FOXF1Q12946 379 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ITGADQ13349 1161 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MFAP5Q13361 173 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 PMS2P3Q13401 168 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 TGIF1Q15583 401 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 NEDD8Q15843 81 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM122BQ7Z309 247 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MARCH9Q86YJ5 346 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CPOQ8IVL8 374 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 EXD3Q8N9H8 876 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF248Q8NDW4 579 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FAR1Q8WVX9 515 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 SGCDQ92629 289 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 RNFT2Q96EX2 444 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 PIGQQ9BRB3 760 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 AMBNQ9NP70 447 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 INIPQ9NRY2 104 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 DKKL1Q9UK85 242 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.06□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 OR5H15A6NDH6 313 aa5.06□□□□□ -1.6
NANOGP9-201ENST00000439890 A6NIZ1 184 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms