RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423636.6

PTPRN-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN, Length 3,313 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-204ENST00000423636 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZNF319Q9P2F9 582 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 R4GN57 208 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 FTCDNL1E5RQL4 147 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 E9PLN8 166 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 STOMP27105 288 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZNF81P51508 661 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CLDN17P56750 224 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TAF13Q15543 124 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TRAM1Q15629 374 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PMS2CLQ68D20 193 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PLPP5Q8NEB5 264 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TMEM138Q9NPI0 162 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 MOKQ9UQ07 419 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 POLEQ07864 2286 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZFAND5O76080 213 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 DBHP09172 617 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GZMKP49863 264 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 DCAF7P61962 342 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 SRYQ05066 204 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GSG1Q2KHT4 349 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 DTX1Q86Y01 620 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 MSANTD3Q96H12 275 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GINS4Q9BRT9 223 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 RAB33BQ9H082 229 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PRR13Q9NZ81 148 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 AKAP13Q12802 2813 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 BLACEA4D250 179 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 C3orf80F5H4A9 247 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 MMP15P51511 669 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZP1P60852 638 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ANGPT1Q15389 498 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CCDC58Q4VC31 144 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR8H3Q8N146 312 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CLDN23Q96B33 292 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR52A1Q9UKL2 312 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 SULT2B1O00204 365 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GPRIN2O60269 458 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 POU4F3Q15319 338 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ZNF227Q86WZ6 799 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR52N5Q8NH56 324 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TMEM234Q8WY98 164 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GHITMQ9H3K2 345 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PISDQ9UG56 409 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 TNFSF11O14788 317 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CTAG2O75638 210 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 RGS11O94810 467 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 UMODP07911 640 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 QDPRP09417 244 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PTGDSP41222 190 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 HSF2Q03933 536 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ASB10Q8WXI3 467 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 SLAMF6Q96DU3 332 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 MNTQ99583 582 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PRO3102Q9H379 93 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 GPR171O14626 319 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PDCD5O14737 125 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PLPPR5Q32ZL2 321 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 PHYHD1Q5SRE7 291 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 FAM57BQ71RH2 274 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 VASH2Q86V25 355 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 OR10S1Q8NGN2 331 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 CHST11Q9NPF2 352 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-204ENST00000423636 LIPT2A6NK58 231 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms