RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 CALCBP10092 127 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 CFPP27918 469 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PPP2R1BP30154 601 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 KHKP50053 298 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 CTSCP53634 463 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LGALS3BPQ08380 585 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ST3GAL3Q11203 375 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 POU4F2Q12837 409 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 APOOLQ6UXV4 268 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LINGO2Q7L985 606 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 KRT78Q8N1N4 520 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SYS1Q8N2H4 156 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LILRB2Q8N423 598 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 NEIL2Q969S2 332 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SPSB2Q99619 263 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 KLHL1Q9NR64 748 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM100Q9NV29 134 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ETV7Q9Y603 341 aa8.6□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1B0GTI1 187 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 A0A1B0GVC2 190 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 DAPL1A0PJW8 107 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 C5orf52A6NGY3 159 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 A6NIN4 97 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ACOD1A6NK06 481 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 IDSB3KWA1 339 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 E9PI62 339 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 H3BMH7 237 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 GPRIN2O60269 458 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SIX6O95475 246 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 IGF2P01344 180 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 IFNA2P01563 188 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 FBP1P09467 338 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF35P13682 527 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC2A5P22732 501 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PMPCAQ10713 525 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 RNF212Q495C1 297 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 CDNFQ49AH0 187 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ARL9Q6T311 187 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 CPOQ8IVL8 374 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LNX2Q8N448 690 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 STOML3Q8TAV4 291 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 LCN9Q8WX39 176 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SGK3Q96BR1 496 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 OR1F2PQ96R84 312 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 NRTNQ99748 197 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 SEC11CQ9BY50 192 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 WDR54Q9H977 334 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 BEX1Q9HBH7 125 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.59□□□□□ -1.03
AP000289.1-201ENST00000421051 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms