RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 E9PI62 339 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 APOC1P02654 83 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CELA3AP09093 270 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MSR1P21757 451 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PAX7P23759 505 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CTSSP25774 331 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FMODQ06828 376 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLC3A1Q07837 685 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MEP1BQ16820 701 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 C22orf42Q6IC83 251 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SYT9Q86SS6 491 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ST7LQ8TDW4 575 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM203Q969S6 136 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SARAFQ96BY9 339 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TMED9Q9BVK6 235 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HMG20AQ9NP66 347 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PALMDQ9NP74 551 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 POLQO75417 2590 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPL8 197 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF878C9JN71 531 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 H0YC42 278 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CDRT1O95170 752 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ISG15P05161 165 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 YES1P07947 543 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 INHBBP09529 407 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 UCHL1P09936 223 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 H2BFMP0C1H6 154 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR8G3PP0DMU2 310 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CD8BP10966 210 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 KLK2P20151 261 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MYL9P24844 172 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 S100A5P33763 92 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RFC3P40938 356 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OPRL1P41146 370 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RANBP1P43487 201 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MMP16P51512 607 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H3AP68431 136 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FAM27BQ5VT28 67 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CARD17Q5XLA6 110 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GJC3Q8NFK1 279 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RELTQ969Z4 430 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MAP6Q96JE9 813 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 C4orf45Q96LM5 186 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 R4GMQ9 66 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MED13Q9UHV7 2174 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RELNP78509 3460 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 AHRRA9YTQ3 701 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PRR32B1ATL7 298 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms