RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PHLDA2Q53GA4 152 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF799Q96GE5 643 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 PKMYT1Q99640 499 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 METTL12A8MUP2 240 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 NME2P22392 152 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 IL3RAP26951 378 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 DOC2BQ14184 412 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 GDPD3Q7L5L3 318 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TEX19Q8NA77 164 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 NANPQ8TBE9 248 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ITGB4P16144 1822 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 EFSO43281 561 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 APEHP13798 732 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RPS23P62266 143 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ASAH1Q13510 395 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OR52I2Q8NH67 350 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM19Q96E16 107 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R5Q9NYW4 299 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS37A4D1T9 235 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RPS10P46783 165 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HMGN3Q15651 99 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 EGLN1Q9GZT9 426 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LRP5O75197 1615 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC10A1Q14973 349 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SOHLH1Q5JUK2 328 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TTC9Q92623 222 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RNF167Q9H6Y7 350 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 AIPO00170 330 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 HCCSP53701 268 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR52H1Q8NGJ2 320 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 NT5CQ8TCD5 201 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 GPR173Q9NS66 373 aa18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 FRG2CA6NGY1 282 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 RFX2P48378 723 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 EDDM3AQ14507 147 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR6K3Q8NGY3 331 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OXGR1Q96P68 337 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZGLP1P0C6A0 271 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SELEP16581 610 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 BAXQ07812 192 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CDK5R1Q15078 307 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CORO6Q6QEF8 472 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 S1PR5Q9H228 398 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 DFFBO76075 338 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 TPBGQ13641 420 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A7Q8NEW0 376 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 TCEAL7Q9BRU2 100 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SRP9P49458 86 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SARAFQ96BY9 339 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SPNS1Q9H2V7 528 aa18.45■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 GPR3P46089 330 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF628Q5EBL2 1059 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 LILRA6Q6PI73 481 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD53Q8N9V6 530 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR51A4Q8NGJ6 313 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 PCK2Q16822 640 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP14A8MT82 685 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 AADACP22760 399 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 DDOSTP39656 456 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR10J5Q8NHC4 309 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CRLF2Q9HC73 371 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 MED29Q9NX70 200 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 KCNG2Q9UJ96 466 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0A6YYD5 115 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ST8SIA3O43173 380 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL13O43927 109 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR2J2O76002 312 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 FUCA1P04066 466 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 CSF3P09919 207 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 OR51F2Q8NH61 342 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 ARSGQ96EG1 525 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD10Q9BYL1 202 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 PPIL1Q9Y3C6 166 aa18.44■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPH5 198 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 SIX6O95475 246 aa18.43■□□□□ 0.54
CCSAP-203ENST00000366687 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms