RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.71□□□□□ -0.05
RXRA-201ENST00000356384 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.71□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.71□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR2A25A4D2G3 310 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 KIR2DL3P43628 341 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 LIM2P55344 173 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 APH1BQ8WW43 257 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CSF3RQ99062 836 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ETV1P50549 477 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 GRINAQ7Z429 371 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SLC39A13Q96H72 371 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 TAPBPO15533 448 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ACHEP22303 614 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 DTYMKP23919 212 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RBP2P50120 134 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR51F2Q8NH61 342 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 MYH8P13535 1937 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 MYH11P35749 1972 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 UMAD1C9J7I0 102 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CORO2AQ92828 525 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 MBOAT4Q96T53 435 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 VPS25Q9BRG1 176 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SIRPB1O00241 398 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SULT1C4O75897 302 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR52I2Q8NH67 350 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 KIAA1456Q9P272 454 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RNF150Q9ULK6 438 aa14.7□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 MYH3P11055 1940 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 DCTN6O00399 190 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SPI1P17947 270 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 PTDSS2Q9BVG9 487 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CTSFQ9UBX1 484 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 A0A1B0GX78 115 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 M0R082 166 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 TCAPO15273 167 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 MYOGP15173 224 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RAD52P43351 418 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 PFN3P60673 137 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SSSCA1O60232 199 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ADRA2CP18825 462 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 C4orf17Q53FE4 359 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 TRNP1Q6NT89 227 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 TEAD3Q99594 435 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 WDR1O75083 606 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CPN1P15169 458 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 GPR12P47775 334 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ZNF85Q03923 595 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 EXT1Q16394 746 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 LIPNQ5VXI9 398 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CDH26Q8IXH8 852 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR13H1Q8NG92 308 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 HDAC8Q9BY41 377 aa14.69□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 DDOSTP39656 456 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR10A3P58181 314 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SYT11Q9BT88 431 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 P2RY12Q9H244 342 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SELEP16581 610 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 NPPBP16860 134 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 SIAEQ9HAT2 523 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 A0A1B0GTW7 788 aa14.68□□□□□ -0.06
RXRA-201ENST00000356384 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms