RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 LNP1A1A4G5 178 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 ZNF43P17038 809 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 OTX2P32243 289 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 SLC35A1P78382 337 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 MFAP5Q13361 173 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 OR6X1Q8NH79 312 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 FCAMRQ8WWV6 532 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 MCUBQ9NWR8 336 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 TAS2R4Q9NYW5 299 aa20.36■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 HHLA2Q9UM44 414 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 A0A0A6YYJ9 748 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 KRT33AO76009 404 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 IGHEP01854 428 aa20.35■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 TAS2R20P59543 309 aa20.35■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.35■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 KLK11Q9UBX7 282 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 RCE1Q9Y256 329 aa20.35■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 OR10S1Q8NGN2 331 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 RNF170Q96K19 258 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 EMC7Q9NPA0 242 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 COPZ2Q9P299 210 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 TTLL8A6PVC2 850 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 SLC17A2O00624 439 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 DHFRP00374 187 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 ACHEP22303 614 aa20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 CDAP32320 146 aa20.34■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 FSTP19883 344 aa20.33■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 Q0VFX4 171 aa20.33■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 FAM166AQ6J272 317 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 NOXA1Q86UR1 476 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 CT55Q8WUE5 264 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 SCMH1Q96GD3 660 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 C1orf198Q9H425 327 aa20.33■□□□□ 0.85
SNX18-201ENST00000326277 FAM206AQ9NX38 181 aa20.33■□□□□ 0.85
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SNX18-201ENST00000326277 GLSO94925 669 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CD63P08962 238 aa20.33■□□□□ 0.84
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SNX18-201ENST00000326277 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.33■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CFAP77Q6ZQR2 320 aa20.33■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.33■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.33■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 OR2M5A3KFT3 312 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ZNF726A6NNF4 738 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 XRCC3O43542 346 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 LMX1BO60663 402 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 DNASE1L1P49184 302 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 H3F3AP84243 136 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 HIST3H3Q16695 136 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 STRADBQ9C0K7 418 aa20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 C7orf66A4D0T2 115 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 ACOT7O00154 380 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 GMDSO60547 372 aa20.31■□□□□ 0.84
SNX18-201ENST00000326277 CTAG2O75638 210 aa20.31■□□□□ 0.84
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