RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 WDR76Q9H967 626 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RASSF1Q9NS23 344 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CACNA1DQ01668 2161 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SGCEO43556 437 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PTHP01270 115 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CD3EP07766 207 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 COX5BP10606 129 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PSKH1P11801 424 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SSTR2P30874 369 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HTR1FP30939 366 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CDH11P55287 796 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 NAAAQ02083 359 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PLP2Q04941 152 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SETD9Q8NE22 299 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TFAP2CQ92754 450 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RFKQ969G6 155 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RADILQ96JH8 1075 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ABCD4O14678 606 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RER1O15258 196 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SYNGR3O43761 229 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 DOK2O60496 412 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TMCC2O75069 709 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CLIC3O95833 236 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CRYAAP02489 173 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 VHLP40337 213 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TLE4Q04727 773 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RAB35Q15286 201 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF774Q6NX45 483 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CORO6Q6QEF8 472 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 B3GLCTQ6Y288 498 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 USP51Q70EK9 711 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 APH1BQ8WW43 257 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 MAP6Q96JE9 813 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 AKAP6Q13023 2319 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PPR1 153 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR6C6A6NF89 314 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SHISA9B4DS77 424 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SELENOFO60613 162 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ENTPD6O75354 484 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SPARCP09486 303 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF35P13682 527 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 APEX1P27695 318 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 CALCRP30988 508 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 HSPA13P48723 471 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ISL1P61371 349 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IL5RAQ01344 420 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SPOCK1Q08629 439 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ELFN2Q5R3F8 820 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SHFQ7M4L6 423 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 DPY19L4Q7Z388 723 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 SLC30A7Q8NEW0 376 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 OTOSQ8NHW6 89 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 ST7LQ8TDW4 575 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC42-201ENST00000293845 POM121L2Q96KW2 1035 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms