RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 F12P00748 615 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 HLA-DQA2P01906 255 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 TP53P04637 393 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 GAAP10253 952 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 HTR5AP47898 357 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 EVX1P49640 407 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 KCNMB1Q16558 191 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SLC36A3Q495N2 470 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 LRP11Q86VZ4 500 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ZNF525Q8N782 197 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 OR10H5Q8NGA6 315 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 OR1J1Q8NGS3 322 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 OR4Q3Q8NH05 313 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 PLEK2Q9NYT0 353 aa21.62■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 RNF223E7ERA6 249 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ADRA2AP08913 450 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 PRKACGP22612 351 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 POU1F1P28069 291 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SELENOVP59797 346 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 PROKR2Q8NFJ6 384 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.61■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 M0R233 179 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SYNGR3O43761 229 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 IFNGP01579 166 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 COX5BP10606 129 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ANXA8P13928 327 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 WNT5AP41221 380 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 DSCR9P59020 149 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 TEKQ02763 1124 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CCNIQ14094 377 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ARL9Q6T311 187 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 DNM1P46Q6ZS02 220 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ASRGL1Q7L266 308 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 BIVMQ86UB2 503 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ZNF101Q8IZC7 436 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SLC26A10Q8NG04 563 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 OR2T4Q8NH00 348 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SYNPRQ8TBG9 265 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SMR3AQ99954 134 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 REV1Q9UBZ9 1251 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa21.6■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 RIIAD1A6NNX1 92 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 EBAG9O00559 213 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 RER1O15258 196 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 TFP02787 698 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 PYCR1P32322 319 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ALDH3B1P43353 468 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CRMP1Q14194 572 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CARTPTQ16568 116 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SPATA46Q5T0L3 261 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 IQCF1Q8N6M8 205 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ABHD4Q8TB40 342 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 FAM168AQ92567 244 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 C4orf45Q96LM5 186 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CDADC1Q9BWV3 514 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 REG4Q9BYZ8 158 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 TPK1Q9H3S4 243 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ELOVL3Q9HB03 270 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 AP4S1Q9Y587 144 aa21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ABHD16AO95870 558 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CLPTM1O96005 669 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CSF3P09919 207 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 NKPD1Q17RQ9 610 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 CORO6Q6QEF8 472 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 GJC3Q8NFK1 279 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 OR1F12Q8NHA8 337 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 DDOQ99489 341 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 MS4A5Q9H3V2 200 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 NTN4Q9HB63 628 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 TAAR3PQ9P1P4 343 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 LHFPL6Q9Y693 200 aa21.58■■□□□ 1.05
PDF-201ENST00000288022 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF250P15622 560 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF3P17036 446 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GCH1P30793 250 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GRK5P34947 590 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 PPP1CBP62140 327 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ATP6AP1Q15904 470 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 LINC00346Q8IVM7 164 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms