RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TBPP20226 339 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR51E1Q8TCB6 317 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CTRCQ99895 268 aa19.28■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPGP15A8MWD9 76 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TFAP2EQ6VUC0 442 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf54Q8N8G6 183 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 MORN4Q8NDC4 146 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 BAK1Q16611 211 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 PLXDC2Q6UX71 529 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 OR2G3Q8NGZ4 309 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ASH2LQ9UBL3 628 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 TCN2P20062 427 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 NAA40Q86UY6 237 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM4Q8IZR5 234 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 RNF170Q96K19 258 aa19.27■□□□□ 0.68
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A6YYJ9 748 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf202A1L168 122 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 DEGS1O15121 323 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SELENBP1Q13228 472 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GCNT2Q8N0V5 402 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR10J5Q8NHC4 309 aa19.27■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 IDSB3KWA1 339 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 WNT11O96014 354 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 QDPRP09417 244 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PRR35P0CG20 571 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ST6GAL1P15907 406 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ADRA2CP18825 462 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TGFBR1P36897 503 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SSTP61278 116 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MYEOVQ96EZ4 313 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CSAG2Q9Y5P2 127 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GTL3 188 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GUH1 482 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CCR5P51681 352 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 AQP6Q13520 282 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CALHM3Q86XJ0 350 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TEX19Q8NA77 164 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf52Q8NHV5 167 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 S1PR5Q9H228 398 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A32Q9H2D1 315 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 LAMA4Q16363 1823 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM235A6NFC5 223 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R2P9O14990 202 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB1P43366 347 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TESK1Q15569 626 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM61Q5EBN2 209 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H3AQ71DI3 136 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A1Q8NGT9 310 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CLN5O75503 358 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A9Q8NBW4 561 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SFT2D1Q8WV19 159 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP13Q9UII6 198 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 HRH3Q9Y5N1 445 aa19.26■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A6P0DMU7 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A5P0DMU8 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A7P0DMV0 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A8P0DMV1 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A9P0DMV2 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A2Q5DJT8 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A1Q5HYN5 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CT45A3Q8NHU0 189 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL4Q9UKA2 621 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS37A4D1T9 235 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB6P28072 239 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TXNIPQ9H3M7 391 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PLK3Q9H4B4 646 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLAMF7Q9NQ25 335 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF576Q9H609 170 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GPR173Q9NS66 373 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GZMKP49863 264 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TXN2Q99757 166 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 RTL8AQ9BWD3 113 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SRRQ9GZT4 340 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF385DQ9H6B1 395 aa19.25■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPE2 198 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PR64 198 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRV1 198 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS8O00214 317 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B6O14756 317 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFB1P0C5Y9 115 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA2P29317 976 aa19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms