RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 CCL25O15444 150 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GJB3O75712 270 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 STK16O75716 305 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TRGC2P03986 189 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR8U9P0C7N5 309 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 CDK2P24941 298 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMB6P28072 239 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NSG1P42857 185 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM129CQ86XR2 697 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35G3Q8N808 338 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NAXEQ8NCW5 288 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR8U1Q8NH10 309 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 MITD1Q8WV92 249 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SMPDL3BQ92485 455 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC22A12Q96S37 553 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 POT1Q9NUX5 634 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 VWA8A3KMH1 1905 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TTC28Q96AY4 2481 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 TAAR5O14804 337 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 UMODP07911 640 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ST6GAL1P15907 406 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZBTB25P24278 435 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 BTG2P78543 158 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF529Q6P280 563 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ARL9Q6T311 187 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SSX7Q7RTT5 188 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SFXN5Q8TD22 340 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 IL26Q9NPH9 171 aa6.67□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 CCL16O15467 120 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TRBC1P01850 177 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CA3P07451 260 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CST2P09228 141 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 TDGF1P13385 188 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 CD34P28906 385 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PNPLA4P41247 253 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 GDF5P43026 501 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PTGER3P43115 390 aa6.66□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 MC1RQ01726 317 aa6.66□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 RUNX2Q13950 521 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.66□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 LINC01551Q86U37 167 aa6.66□□□□□ -1.34
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GTF2E1-201ENST00000283875 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4C6Q8NH72 309 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXO32Q969P5 355 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SGCZQ96LD1 299 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 NDC1Q9BTX1 674 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.66□□□□□ -1.34
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.66□□□□□ -1.34
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