RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 SYS1Q8N2H4 156 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 NPEPL1Q8NDH3 523 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ATF6BQ99941 703 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MEIOCA2RUB1 952 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SELENOVP59797 346 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PELI1Q96FA3 418 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 RNF170Q96K19 258 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PSD2Q9BQI7 771 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CRLF2Q9HC73 371 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 GPR84Q9NQS5 396 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 FBXO8Q9NRD0 319 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 KNG1P01042 644 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SDHBP21912 280 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MICU1Q9BPX6 476 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 R4GMQ9 66 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 TSPAN2O60636 221 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SERPINA7P05543 415 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 NAGAP17050 411 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 GCH1P30793 250 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MAP2K6P52564 334 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CFHR1Q03591 330 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SIAH3Q8IW03 269 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 GALNT16Q8N428 558 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.27□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OBSL1O75147 1896 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 VAMP5O95183 116 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SFTPBP07988 381 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 AKAIN1P0CW23 69 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PMPCAQ10713 525 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 STPG1Q5TH74 334 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OR10D3Q8NH80 312 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 TOMM40LQ969M1 308 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 A0A1W2PR80 420 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 RER1O15258 196 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 BGLAPP02818 100 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 THY1P04216 161 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MAGEA5P43359 124 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PRSS12P56730 875 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MCHR2Q969V1 340 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 WDR54Q9H977 334 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 FOXJ2Q9P0K8 574 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 C5orf49A4QMS7 147 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PATE4P0C8F1 98 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 TIGD3Q6B0B8 471 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MRGPREQ86SM8 312 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ASB10Q8WXI3 467 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 GPR171O14626 319 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 FGF5P12034 268 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 THBS2P35442 1172 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 TNK1Q13470 666 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OR2M3Q8NG83 312 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 UCN2Q96RP3 112 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OR2M5A3KFT3 312 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 M0QYG6 137 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CSF1P09603 554 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CDK2P24941 298 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 BDH1Q02338 343 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 TGIF1Q15583 401 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 OR10K2Q6IF99 312 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 GLTPQ9NZD2 209 aa9.26□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.25□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.25□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 CNR1P21554 472 aa9.25□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 SLC25A1P53007 311 aa9.25□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 DGCR2P98153 550 aa9.25□□□□□ -0.93
TTPAL-201ENST00000262605 TATDN3Q17R31 274 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms