RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 HPGDP15428 266 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 24.5
LMO2-201ENST00000257818 RNF128Q8TEB7 428 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 TCTN2Q96GX1 697 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 EDEM2Q9BV94 578 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 A0A1W2PPC1 479 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MPTX1A8MV57 137 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF264O43296 627 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DOK2O60496 412 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 HLA-DQA2P01906 255 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 FOSL2P15408 326 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 GLYATL3Q5SZD4 288 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF679Q8IYX0 411 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 OR13C8Q8NGS7 320 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ASB5Q8WWX0 329 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 TAS2R4Q9NYW5 299 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SPEGQ15772 3267 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 A0A1B0GW55 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 LILRA5A6NI73 299 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 LMO7DNF2Z398 122 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CCSO14618 274 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 HTR2CP28335 458 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 FGL1Q08830 312 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF345Q14585 488 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 BEX5Q5H9J7 111 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 UCK1Q9HA47 277 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DUX4Q9UBX2 424 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 B9D1Q9UPM9 204 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 DHDHQ9UQ10 334 aa22.17■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 RNF222A6NCQ9 220 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 C11orf98E9PRG8 122 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 BCL2L11O43521 198 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 GMFGO60234 142 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF28P17035 718 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 PRKACAP17612 351 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CNR1P21554 472 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 STARP49675 285 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MC2RQ01718 297 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MOGAT2Q3SYC2 334 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 C11orf87Q6NUJ2 197 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF321PQ8N8H1 164 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SLC6A7Q99884 636 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SCPEP1Q9HB40 452 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 KLK13Q9UKR3 277 aa22.16■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SCDO00767 359 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CD74P04233 296 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SLC25A4P12235 298 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CD34P28906 385 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 OR2W3Q7Z3T1 314 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MDGA2Q7Z553 956 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF563Q8TA94 476 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SLC6A15Q9H2J7 730 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CLDN4O14493 209 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 OR2F2O95006 317 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 UTS2O95399 124 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 LIPCP11150 499 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 RAB3AP20336 220 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CENPAP49450 140 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 OR2F1Q13607 317 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 BPIFB2Q8N4F0 458 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 OR51A2Q8NGJ7 313 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 SEC22AQ96IW7 307 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ADAM19Q9H013 955 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 C17orf51A8MQB3 221 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 WISP1O95388 367 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 CYB5AP00167 134 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 PLGP00747 810 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
LMO2-201ENST00000257818 BGLAPP02818 100 aa22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms