RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 MTSS1LQ765P7 747 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 RNF186Q9NXI6 227 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC2A8Q9NY64 477 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MAFFQ9ULX9 164 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC35G4P0C7Q5 338 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 WDR38Q5JTN6 314 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 METRNLQ641Q3 311 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 Q6ZRG5 221 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZNF565Q8N9K5 539 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SOCS4Q8WXH5 440 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 OR5B2Q96R09 309 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 PIGQQ9BRB3 760 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TAF9BQ9HBM6 251 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC31A2O15432 143 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DOK2O60496 412 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 EFEMP2O95967 443 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 HOXB5P09067 269 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ADRB3P13945 408 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 HOXA5P20719 270 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GLYATL3Q5SZD4 288 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OTPQ5XKR4 325 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 AWAT2Q6E213 333 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 KIRREL2Q6UWL6 708 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZDHHC22Q8N966 263 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR6N2Q8NGY6 317 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 S100PBPQ96BU1 408 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MALSU1Q96EH3 234 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CHST5Q9GZS9 411 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ARPC3O15145 178 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ADH1AP07327 375 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SULT1A1P50225 295 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DPY19L4Q7Z388 723 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ANGPTL5Q86XS5 388 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CDC20BQ86Y33 519 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RAB33BQ9H082 229 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GFOD1Q9NXC2 390 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PRR13Q9NZ81 148 aa19.14■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 H7C1C5 153 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 LATO43561 262 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 HTR2CP28335 458 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 S100A2P29034 98 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RBP2P50120 134 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 LCN6P62502 163 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TOMM20Q15388 145 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SHISA5Q8N114 240 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ACBD4Q8NC06 268 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR51F2Q8NH61 342 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 NKD1Q969G9 470 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 C4orf45Q96LM5 186 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SLC46A2Q9BY10 475 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SLC5A7Q9GZV3 580 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SPACA1Q9HBV2 294 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR10H2O60403 315 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DNAJB6O75190 326 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ADAP1O75689 374 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GABRA3P34903 492 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CX3CR1P49238 355 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R14AQ96A00 147 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 IGSF21Q96ID5 467 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 UCK1Q9HA47 277 aa19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 BRINP1O60477 761 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GPANK1O95872 356 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 IFNA17P01571 189 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SULT1A2P50226 295 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TAS2R60P59551 318 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 HMGN3Q15651 99 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TCTN1Q2MV58 587 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 AMELYQ99218 206 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CMKLR1Q99788 373 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 WDR76Q9H967 626 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 FBXL21Q9UKT6 434 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR52A4PA6NMU1 304 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MOSPD3O75425 235 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RAB28P51157 221 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PRSS54Q6PEW0 395 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 FJX1Q86VR8 437 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GKN2Q86XP6 184 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RAB42Q8N4Z0 105 aa19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms